The Shell Cmds popup menu items are configured in:
Settings->Preferences->Interface->Shell Commands
This runs a dialog that lets you Add/Del/Edit the items in the main menu popup.  Possible options are:
 
1) Add a new menu item/script: 
    click Add
    in the Label box, change the word "new" to the desired menu label
    in the Commands box, type the command lines to be included in the script
    (for example: Label => gimp; Commands => gimp)
    check-OK in the Commands window
    check-OK in the Shell window
    click on OK or Apply in the Preferences window (WILL NOT TAKE EFFECT UNTIL CLICK)
2) Del to delete an existing menu item (for example manual):
     select to highlight an entry in the Cinelerra: Shell listbox
     click Del 
     check-OK in the Shell window
     click on OK or Apply in the Preferences window (the entry is destroyed)
3) Edit an existing menu item:
    click Edit
    select to highlight an entry in the Cinelerra: Shell listbox
    click edit (the edit dialog appears)
    set the label and/or commands to the new desired values
    check-OK in the Shell window
    click on OK or Apply in the Preferences window